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一株B亞型人呼吸道合胞病毒蘭州分離株的全基因序列測定及其分子特征分析

摘要:人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是每年引起嬰幼兒和老年人下呼吸道感染的主要病毒性病原,在全球造成了高疾病負擔,明確RSV流行毒株的遺傳背景是其流行病學研究和預防控制的基礎。為了解HRSV蘭州分離株RSV B/LZ11/12的全基因組序列、分子結構特征及遺傳變異情況,本研究對其全基因組進行擴增克隆和測序后,與GenBank中相關的參考毒株序列構建系統發生樹并進行遺傳進化及相似性分析。針對其主要蛋白F、G和SH的氨基酸進行了比對和差異分析,并對F蛋白的N-糖基化位點進行分析。結果表明B/LZ11/12與B亞型RSV的核苷酸同源性高達99%以上,其基因組全長15 275bp,具有RSV的所有結構特征。遺傳進化分析顯示,B/LZ11/12與B/GZ/13-730、B/England138/2016和SC2225同屬于一個分支,提示親緣關系最近。G基因遺傳進化樹表明該毒株屬于RSV B亞型BA9基因型。主要氨基酸位點分析顯示該毒株的G基因和F基因均具有一個特有的變化,即Glu87Gly和Val243Ala的氨基酸替換。F蛋白N-糖基化位點分析顯示該毒株具有RSV F蛋白的5個共有修飾位點,即27~30(NITE)、70~73(NGTD)、116~119(NYTI)、120~123(NTTK)和126~129(NVSI)。相似性分析表明整個基因組最易變異的區域在SH和G基因,其次是NS1、NS2和L基因的3′端。本研究首次獲得了RSV B/LZ11/12蘭州分離株全基因組序列,并闡明了其基因組分子結構特征,該結果對RSV病毒的基因及氨基酸數據庫進行了數據補充,也為我國RSV流行病學數據進行了補充。

關鍵詞:
  • b亞型  
  • 基因組序列分析  
  • 分子特征  
作者:
傅生芳; 王婉; 馬超
單位:
蘭州生物制品研究所有限責任公司第二研究室; 蘭州730046
刊名:
病毒學報

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期刊名稱:病毒學報

病毒學報雜志緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:11-1865/R。堅持指導性與實用性相結合的原則,創辦于1985年,雜志在全國同類期刊中發行數量名列前茅。

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